Após consolidar a presença das irmãs salesianas em algumas cidades mineiras e goianas, a Inspetoria Madre Mazzarello, uma instituição católica sem fins lucrativos, presente nos estados de Minas Gerais, Goiás e Distrito Federal, decidiu expandir-se. Em 24 de fevereiro de 1956, inaugurou o Instituto Auxiliadora, abrindo suas portas para o primeiro grupo de alunas.
Fundamentada na prática filosófica e pedagógica idealizada por Dom Bosco, a unidade ampliou os cursos oferecidos e desenvolve-se, reafirmando a tradição de confiança da população são-joanense na educação salesiana.
Os alunos do Instituto Auxiliadora contam com um projeto pedagógico de excelência em aprendizagem, além da formação pautada em valores éticos e cristãos, uma vez que acreditamos ser possível educar crianças, adolescentes e jovens para que sejam conscientes, competentes, protagonistas e comprometidos com a cidadania.